2022-08-25 12:54:55 +02:00
|
|
|
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
|
|
|
|
|
% Please edit documentation in R/laskeMuutokset12345.R
|
|
|
|
|
\name{admix1_muutokset}
|
|
|
|
|
\alias{admix1_muutokset}
|
2022-08-25 13:03:36 +02:00
|
|
|
\title{Calculate changes (admix1 class)}
|
2022-08-25 12:54:55 +02:00
|
|
|
\description{
|
|
|
|
|
Palauttaa npops*npops taulun, jonka alkio (i,j) kertoo, mik?on
|
|
|
|
|
muutos logml:ss? mikäli populaatiosta i siirretään osuuden verran
|
|
|
|
|
todennäköisyysmassaa populaatioon j. Mikäli populaatiossa i ei ole mitään
|
|
|
|
|
siirrettävää, on vastaavassa kohdassa rivi nollia.
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
\section{Methods}{
|
|
|
|
|
\subsection{Public methods}{
|
|
|
|
|
\itemize{
|
|
|
|
|
\item \href{#method-admix1_muutokset-laskeMuutokset4}{\code{admix1_muutokset$laskeMuutokset4()}}
|
|
|
|
|
\item \href{#method-admix1_muutokset-clone}{\code{admix1_muutokset$clone()}}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<hr>}}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<a id="method-admix1_muutokset-laskeMuutokset4"></a>}}
|
|
|
|
|
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-admix1_muutokset-laskeMuutokset4}{}}}
|
|
|
|
|
\subsection{Method \code{laskeMuutokset4()}}{
|
|
|
|
|
\subsection{Usage}{
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{admix1_muutokset$laskeMuutokset4(osuus, osuusTaulu, omaFreqs, logml)}\if{html}{\out{</div>}}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
\subsection{Arguments}{
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
|
|
|
|
\describe{
|
|
|
|
|
\item{\code{osuus}}{Percentages?}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
\item{\code{osuusTaulu}}{Percentage table?}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
\item{\code{omaFreqs}}{own Freqs?}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
\item{\code{logml}}{log maximum likelihood}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{</div>}}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<hr>}}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<a id="method-admix1_muutokset-clone"></a>}}
|
|
|
|
|
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-admix1_muutokset-clone}{}}}
|
|
|
|
|
\subsection{Method \code{clone()}}{
|
|
|
|
|
The objects of this class are cloneable with this method.
|
|
|
|
|
\subsection{Usage}{
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{admix1_muutokset$clone(deep = FALSE)}\if{html}{\out{</div>}}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
\subsection{Arguments}{
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
|
|
|
|
\describe{
|
|
|
|
|
\item{\code{deep}}{Whether to make a deep clone.}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
\if{html}{\out{</div>}}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
}
|
|
|
|
|
}
|