max/ourMELONS
1
0
Fork 0
Code Issues 1 Pull requests Projects Releases Packages Wiki Activity Actions

Refactored remaining laskeMuutokset as R6 methods

Browse source
This commit is contained in:
Waldir Leoncio 2022-08-25 13:48:17 +02:00
parent c05a500d5f
commit 3efb54d8b5
3 changed files with 354 additions and 162 deletions
Download patch file Download diff file Expand all files Collapse all files

163
man/greedyMix_muutokset.Rd Normal file
View file

@ -0,0 +1,163 @@
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/laskeMuutokset12345.R
\name{greedyMix_muutokset}
\alias{greedyMix_muutokset}
\title{Calculate changes (greedyMix class)}
\description{
Palauttaa npops*1 taulun, jossa i:s alkio kertoo, mik<69> olisi
muutos logml:ss<73>, mik<69>li yksil<69> ind siirret<65><74>n koriin i.
diffInCounts on poistettava COUNTS:in siivusta i1 ja lis<69>tt<74>v<EFBFBD>
COUNTS:in siivuun i2, mik<69>li muutos toteutetaan.
Lis<EFBFBD>ys 25.9.2007:
Otettu k<>ytt<74><74>n globaali muuttuja LOGDIFF, johon on tallennettu muutokset
logml:ss<73> siirrett<74>ess<73> yksil<69>it<69> toisiin populaatioihin.
}
\section{Methods}{
\subsection{Public methods}{
\itemize{
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset()}}
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset2()}}
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset3()}}
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset5()}}
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-clone}{\code{greedyMix_muutokset$clone()}}
}
}
\if{html}{\out{<hr>}}
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset"></a>}}
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset}{}}}
\subsection{Method \code{laskeMuutokset()}}{
\subsection{Usage}{
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset(ind, globalRows, data, adjprior, priorTerm)}\if{html}{\out{</div>}}
}
\subsection{Arguments}{
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
\describe{
\item{\code{ind}}{ind}
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
\item{\code{data}}{data}
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
}
\if{html}{\out{</div>}}
}
}
\if{html}{\out{<hr>}}
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2"></a>}}
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2}{}}}
\subsection{Method \code{laskeMuutokset2()}}{
\subsection{Usage}{
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset2(i1, globalRows, data, adjprior, priorTerm)}\if{html}{\out{</div>}}
}
\subsection{Arguments}{
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
\describe{
\item{\code{i1}}{i1}
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
\item{\code{data}}{data}
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
}
\if{html}{\out{</div>}}
}
}
\if{html}{\out{<hr>}}
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3"></a>}}
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3}{}}}
\subsection{Method \code{laskeMuutokset3()}}{
\subsection{Usage}{
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset3(
T2,
inds2,
globalRows,
data,
adjprior,
priorTerm,
i1
)}\if{html}{\out{</div>}}
}
\subsection{Arguments}{
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
\describe{
\item{\code{T2}}{T2}
\item{\code{inds2}}{inds2}
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
\item{\code{data}}{data}
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
\item{\code{i1}}{i1}
}
\if{html}{\out{</div>}}
}
}
\if{html}{\out{<hr>}}
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5"></a>}}
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5}{}}}
\subsection{Method \code{laskeMuutokset5()}}{
\subsection{Usage}{
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset5(
inds,
globalRows,
data,
adjprior,
priorTerm,
i1,
i2
)}\if{html}{\out{</div>}}
}
\subsection{Arguments}{
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
\describe{
\item{\code{inds}}{inds}
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
\item{\code{data}}{data}
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
\item{\code{i1}}{i1}
\item{\code{i2}}{i2}
}
\if{html}{\out{</div>}}
}
}
\if{html}{\out{<hr>}}
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-clone"></a>}}
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-clone}{}}}
\subsection{Method \code{clone()}}{
The objects of this class are cloneable with this method.
\subsection{Usage}{
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$clone(deep = FALSE)}\if{html}{\out{</div>}}
}
\subsection{Arguments}{
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
\describe{
\item{\code{deep}}{Whether to make a deep clone.}
}
\if{html}{\out{</div>}}
}
}
}