172 lines
4.4 KiB
R
172 lines
4.4 KiB
R
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
|
||
% Please edit documentation in R/laskeMuutokset12345.R
|
||
\name{greedyMix_muutokset}
|
||
\alias{greedyMix_muutokset}
|
||
\title{Calculate changes (greedyMix class)}
|
||
\description{
|
||
Palauttaa npops*1 taulun, jossa i:s alkio kertoo, mik<EFBFBD> olisi
|
||
muutos logml:ss<EFBFBD>, mik<EFBFBD>li yksil<EFBFBD> ind siirret<EFBFBD><EFBFBD>n koriin i.
|
||
diffInCounts on poistettava COUNTS:in siivusta i1 ja lis<EFBFBD>tt<EFBFBD>v<EFBFBD>
|
||
COUNTS:in siivuun i2, mik<EFBFBD>li muutos toteutetaan.
|
||
|
||
Lis<EFBFBD>ys 25.9.2007:
|
||
Otettu k<EFBFBD>ytt<EFBFBD><EFBFBD>n globaali muuttuja LOGDIFF, johon on tallennettu muutokset
|
||
logml:ss<EFBFBD> siirrett<EFBFBD>ess<EFBFBD> yksil<EFBFBD>it<EFBFBD> toisiin populaatioihin.
|
||
}
|
||
\section{Methods}{
|
||
\subsection{Public methods}{
|
||
\itemize{
|
||
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset()}}
|
||
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset2()}}
|
||
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset3()}}
|
||
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5}{\code{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset5()}}
|
||
\item \href{#method-greedyMix_muutokset-clone}{\code{greedyMix_muutokset$clone()}}
|
||
}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{<hr>}}
|
||
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset"></a>}}
|
||
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset}{}}}
|
||
\subsection{Method \code{laskeMuutokset()}}{
|
||
\subsection{Usage}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset(
|
||
ind,
|
||
globalRows,
|
||
data,
|
||
adjprior,
|
||
priorTerm,
|
||
npops
|
||
)}\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
|
||
\subsection{Arguments}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
||
\describe{
|
||
\item{\code{ind}}{ind}
|
||
|
||
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
|
||
|
||
\item{\code{data}}{data}
|
||
|
||
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
|
||
|
||
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
|
||
|
||
\item{\code{npops}}{Number of populations}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{<hr>}}
|
||
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2"></a>}}
|
||
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset2}{}}}
|
||
\subsection{Method \code{laskeMuutokset2()}}{
|
||
\subsection{Usage}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset2(i1, globalRows, data, adjprior, priorTerm)}\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
|
||
\subsection{Arguments}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
||
\describe{
|
||
\item{\code{i1}}{i1}
|
||
|
||
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
|
||
|
||
\item{\code{data}}{data}
|
||
|
||
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
|
||
|
||
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{<hr>}}
|
||
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3"></a>}}
|
||
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset3}{}}}
|
||
\subsection{Method \code{laskeMuutokset3()}}{
|
||
\subsection{Usage}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset3(
|
||
T2,
|
||
inds2,
|
||
globalRows,
|
||
data,
|
||
adjprior,
|
||
priorTerm,
|
||
i1
|
||
)}\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
|
||
\subsection{Arguments}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
||
\describe{
|
||
\item{\code{T2}}{T2}
|
||
|
||
\item{\code{inds2}}{inds2}
|
||
|
||
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
|
||
|
||
\item{\code{data}}{data}
|
||
|
||
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
|
||
|
||
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
|
||
|
||
\item{\code{i1}}{i1}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{<hr>}}
|
||
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5"></a>}}
|
||
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-laskeMuutokset5}{}}}
|
||
\subsection{Method \code{laskeMuutokset5()}}{
|
||
\subsection{Usage}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$laskeMuutokset5(
|
||
inds,
|
||
globalRows,
|
||
data,
|
||
adjprior,
|
||
priorTerm,
|
||
i1,
|
||
i2
|
||
)}\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
|
||
\subsection{Arguments}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
||
\describe{
|
||
\item{\code{inds}}{inds}
|
||
|
||
\item{\code{globalRows}}{globalRows}
|
||
|
||
\item{\code{data}}{data}
|
||
|
||
\item{\code{adjprior}}{adjprior}
|
||
|
||
\item{\code{priorTerm}}{priorTerm}
|
||
|
||
\item{\code{i1}}{i1}
|
||
|
||
\item{\code{i2}}{i2}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{<hr>}}
|
||
\if{html}{\out{<a id="method-greedyMix_muutokset-clone"></a>}}
|
||
\if{latex}{\out{\hypertarget{method-greedyMix_muutokset-clone}{}}}
|
||
\subsection{Method \code{clone()}}{
|
||
The objects of this class are cloneable with this method.
|
||
\subsection{Usage}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="r">}}\preformatted{greedyMix_muutokset$clone(deep = FALSE)}\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
|
||
\subsection{Arguments}{
|
||
\if{html}{\out{<div class="arguments">}}
|
||
\describe{
|
||
\item{\code{deep}}{Whether to make a deep clone.}
|
||
}
|
||
\if{html}{\out{</div>}}
|
||
}
|
||
}
|
||
}
|